目前，SNP檢測(cè)作為最新的分子標(biāo)記檢測(cè)方法，已被眾多國(guó)際組織，如國(guó)際種子檢驗(yàn)協(xié)會(huì)(ISTA)、國(guó)際植物新品種保護(hù)聯(lián)盟(UPOV)、國(guó)際種子聯(lián)盟(ISF)等，推薦為DNA水平上品種鑒定的方法。杜邦先鋒、孟山都和先正達(dá)等國(guó)際一流農(nóng)業(yè)公司也都采用了SNP標(biāo)記對(duì)內(nèi)部的育種材料和不同品種進(jìn)行分類(lèi)鑒定。農(nóng)業(yè)部最近印發(fā)的《農(nóng)作物品種DNA身份鑒定體系構(gòu)建實(shí)施方案》也標(biāo)志著我國(guó)DNA水平上的品種鑒定將實(shí)施采用SNP技術(shù)。

　　我們知道，不同人在基因水平上是有很大差異的。同樣，同一作物的不同品種在DNA水平上也有很多差異，SNP是由單個(gè)核苷酸(A,T,C,G)的改變而引起的DNA序列的變化。例如在一個(gè)品種中某一位點(diǎn)上的核苷酸是A，但在另一品種中則變成了T，這種單核苷酸水平上的變化可以穩(wěn)定遺傳，并能通過(guò)一定手段被準(zhǔn)確檢測(cè)。品種之間也有不少位點(diǎn)存在著這樣的穩(wěn)定差異，通過(guò)比較不同的SNP位點(diǎn)就可有效區(qū)分不同的品種和育種材料。

　　目前常用的SNP檢測(cè)方法有3種：

　　高通量SNP檢測(cè)。用PCR的方法特異擴(kuò)增目標(biāo)位點(diǎn)，在反應(yīng)體系中加上能區(qū)分SNP型的熒光引物或探針，反應(yīng)完成后通過(guò)檢測(cè)熒光信號(hào)就可以判斷該SNP位點(diǎn)上核苷酸類(lèi)型。這種檢測(cè)方法已經(jīng)非常成熟，全程可使用自動(dòng)化技術(shù)，檢測(cè)過(guò)程無(wú)需人為干預(yù)，因而具有成本低、可重復(fù)性高、快速準(zhǔn)確可靠等特點(diǎn)，非常適合對(duì)大量樣本的SNP檢測(cè)。華智水稻生物技術(shù)有限公司引進(jìn)的LGCSNPLine系統(tǒng)和道格拉斯的ArrayTape系統(tǒng)即屬于該類(lèi)，可迅速檢測(cè)幾百到幾萬(wàn)份樣本中的SNP位點(diǎn)。

　　SNP芯片技術(shù)。將大量的SNP探針固定在一張芯片上，將品種樣本DNA與芯片雜交，通過(guò)采集芯片上的熒光信號(hào)，可一次檢測(cè)該品種中成千上萬(wàn)個(gè)SNP位點(diǎn)。目前市面上已有Affymetrix和Illumina公司提供SNP芯片和相應(yīng)設(shè)備。比較而言，SNP芯片技術(shù)檢測(cè)一個(gè)樣本的成本較高。

　　測(cè)序檢測(cè)。該方法通過(guò)對(duì)全基因組或目標(biāo)位點(diǎn)擴(kuò)增后進(jìn)行測(cè)序，直接讀取相關(guān)位點(diǎn)的核苷酸堿基類(lèi)型，從而可檢測(cè)出不同品種間的SNP位點(diǎn)差異。該方法能產(chǎn)生大量的序列數(shù)據(jù)，可能發(fā)現(xiàn)一些未知的DNA變異，但需要專(zhuān)業(yè)的生物信息分析，目前成本相對(duì)比較高，技術(shù)的成熟度也不如前兩種。

　　高通量SNP檢測(cè)方法對(duì)DNA樣本的質(zhì)量要求不高，可使用全自動(dòng)設(shè)備提取的DNA樣本，操作簡(jiǎn)捷快速。SNP檢測(cè)過(guò)程全程自動(dòng)化操作，無(wú)需開(kāi)蓋操作，不僅結(jié)果準(zhǔn)確，重復(fù)性高，還能降低人工和試劑的成本，其功能類(lèi)似于識(shí)別品種身份的“讀卡器”。更多相關(guān)信息，還請(qǐng)您繼續(xù)關(guān)注我們的官方網(wǎng)站，環(huán)球糧機(jī)網(wǎng) http://www.jpdesign.cn/